日前，由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室牽頭完成的重大研究成果《高雜合度荔枝基因組中兩個(gè)不同單倍型表明早晚熟栽培品種各自獨(dú)立馴化》一文發(fā)表于《自然—遺傳學(xué)》(Nature Genetics)。該研究成果將為未來(lái)荔枝功能基因組研究提供重要的參考，對(duì)促進(jìn)荔枝品種改良和產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要意義。

　　2021年國(guó)內(nèi)荔枝生產(chǎn)總產(chǎn)值達(dá)140億元以上。廣東是全國(guó)荔枝第一大省，面積和產(chǎn)量占全國(guó)“半壁江山”。產(chǎn)業(yè)發(fā)展離不開科技支撐。基因組是植物性狀形成的“導(dǎo)航圖”，解碼荔枝基因組，不僅能全面提升對(duì)荔枝重要經(jīng)濟(jì)性狀形成機(jī)制的認(rèn)知，研發(fā)相應(yīng)的育種和栽培調(diào)控技術(shù)，還能為推動(dòng)其他無(wú)患子科植物如龍眼的相關(guān)研究提供重要參考。

　　在華南農(nóng)業(yè)大學(xué)李建國(guó)研究員和胡桂兵教授負(fù)責(zé)的荔枝基因組項(xiàng)目研究中，科學(xué)家們利用二代Illunina、三代PacBio、Hi-C和10XGenomics等最新的基因組測(cè)序數(shù)據(jù)，通過優(yōu)化基因組組裝策略，完成“妃子笑”荔枝基因組假染色體水平的組裝，組裝完整度BUSCO評(píng)估96.2%;同時(shí)完成基因組編碼基因的結(jié)構(gòu)注釋，得到31896個(gè)結(jié)構(gòu)基因，注釋完整度BUSCO評(píng)估94.8%。荔枝基因密碼的破譯將為未來(lái)荔枝功能基因組研究提供重要的參考。

　　荔枝鮮果上市主要集中在5至7月，生產(chǎn)中時(shí)常出現(xiàn)果品季節(jié)性過剩，嚴(yán)重影響了荔枝種植的經(jīng)濟(jì)效益。該論文從基因組層面對(duì)荔枝開花調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了系統(tǒng)性研究，發(fā)現(xiàn)荔枝中一段特定的DNA序列缺失，可能是導(dǎo)致荔枝不同花期形成的重要因素。

　　“這一段DNA序列缺失與荔枝花期早晚關(guān)系緊密。來(lái)源于云南的特早熟品種基因組有這個(gè)缺失，但來(lái)源于海南的晚熟品種中沒有。而‘妃子笑’作為特早熟和晚熟的雜交種，則是‘雜合’的缺失，也就是說(shuō)‘妃子笑’的兩條同源染色體中一條(來(lái)源于特早熟的父本)有這個(gè)缺失，而另外一條(來(lái)源于晚熟的母本)沒有。這也正好與‘妃子笑’的開花期在特早熟和晚熟之間相對(duì)應(yīng)。”華南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院教授夏瑞說(shuō)。

　　這個(gè)DNA序列缺失可以開發(fā)為簡(jiǎn)便的分子標(biāo)記，用于不同開花期荔枝品種的選育。這對(duì)荔枝針對(duì)花期和成熟期性狀的選育種工作非常有價(jià)值，因?yàn)槔笾σ赘癄€、難貯存，選育更多極早或極晚開花的荔枝新品種對(duì)延長(zhǎng)荔枝上市季節(jié)、減少市場(chǎng)季節(jié)性銷售壓力、提升荔枝種植效益非常重要。(記者吳春燕、雷愛俠)